Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD8P13378 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms