Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms