Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr4a1P12813 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms