Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fv4P11370 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fv4P11370 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fv4P11370 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fv4P11370 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Fv4P11370 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fv4P11370 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fv4P11370 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fv4P11370 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fv4P11370 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fv4P11370 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fv4P11370 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fv4P11370 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fv4P11370 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fv4P11370 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fv4P11370 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fv4P11370 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms