Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nid1P10493 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nid1P10493 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nid1P10493 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nid1P10493 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nid1P10493 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nid1P10493 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms