Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms