Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna6P07350 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifna6P07350 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifna6P07350 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifna6P07350 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna6P07350 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms