Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtrP07309 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtrP07309 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TtrP07309 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtrP07309 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtrP07309 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtrP07309 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtrP07309 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtrP07309 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtrP07309 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtrP07309 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtrP07309 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtrP07309 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtrP07309 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtrP07309 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtrP07309 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtrP07309 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtrP07309 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtrP07309 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtrP07309 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtrP07309 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtrP07309 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtrP07309 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtrP07309 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtrP07309 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtrP07309 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtrP07309 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtrP07309 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtrP07309 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtrP07309 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtrP07309 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtrP07309 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtrP07309 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtrP07309 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtrP07309 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtrP07309 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtrP07309 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtrP07309 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TtrP07309 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TtrP07309 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TtrP07309 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TtrP07309 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TtrP07309 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TtrP07309 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TtrP07309 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TtrP07309 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TtrP07309 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TtrP07309 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TtrP07309 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TtrP07309 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TtrP07309 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TtrP07309 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TtrP07309 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TtrP07309 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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TtrP07309 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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TtrP07309 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TtrP07309 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TtrP07309 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TtrP07309 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TtrP07309 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TtrP07309 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TtrP07309 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TtrP07309 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TtrP07309 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TtrP07309 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TtrP07309 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TtrP07309 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TtrP07309 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TtrP07309 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TtrP07309 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TtrP07309 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TtrP07309 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TtrP07309 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TtrP07309 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TtrP07309 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TtrP07309 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TtrP07309 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TtrP07309 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TtrP07309 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TtrP07309 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TtrP07309 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtrP07309 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtrP07309 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtrP07309 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtrP07309 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtrP07309 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtrP07309 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtrP07309 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtrP07309 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtrP07309 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtrP07309 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtrP07309 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtrP07309 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtrP07309 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TtrP07309 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtrP07309 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TtrP07309 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtrP07309 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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