Protein–RNA interactions for Protein: P04940

Ig kappa chain V-VI region NQ2-17.4.1, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04940 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04940 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P04940 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04940 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04940 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P04940 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04940 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04940 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04940 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04940 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04940 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04940 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04940 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04940 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04940 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04940 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04940 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04940 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04940 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04940 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04940 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04940 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04940 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04940 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04940 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04940 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04940 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04940 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04940 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04940 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04940 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04940 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04940 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04940 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04940 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04940 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P04940 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04940 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04940 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04940 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04940 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04940 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04940 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04940 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04940 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04940 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04940 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04940 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04940 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P04940 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P04940 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04940 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04940 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04940 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04940 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P04940 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04940 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04940 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04940 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04940 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04940 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04940 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04940 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04940 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04940 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04940 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04940 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04940 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P04940 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04940 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P04940 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04940 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04940 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04940 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04940 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04940 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04940 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04940 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04940 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04940 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04940 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04940 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04940 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04940 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04940 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04940 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04940 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04940 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04940 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04940 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04940 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04940 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04940 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04940 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04940 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04940 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04940 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04940 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04940 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04940 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms