Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms