Protein–RNA interactions for Protein: P01801

Ig heavy chain V-III region J606, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01801 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01801 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01801 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01801 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01801 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01801 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01801 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01801 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01801 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01801 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01801 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01801 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01801 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01801 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01801 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01801 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01801 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01801 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01801 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01801 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01801 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01801 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01801 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01801 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01801 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01801 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01801 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01801 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01801 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01801 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01801 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01801 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01801 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01801 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01801 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01801 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01801 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01801 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01801 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01801 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01801 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01801 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01801 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01801 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01801 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01801 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01801 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01801 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01801 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01801 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01801 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01801 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01801 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01801 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01801 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01801 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01801 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01801 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01801 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01801 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01801 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01801 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01801 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01801 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01801 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01801 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01801 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01801 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01801 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01801 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01801 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01801 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01801 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01801 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01801 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01801 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01801 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01801 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01801 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01801 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01801 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01801 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01801 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01801 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01801 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01801 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01801 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01801 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01801 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01801 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01801 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01801 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01801 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01801 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01801 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01801 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01801 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01801 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01801 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01801 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms