Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01659 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01659 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01659 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01659 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01659 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01659 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01659 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01659 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01659 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01659 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01659 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01659 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01659 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01659 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01659 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01659 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01659 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01659 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01659 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01659 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01659 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01659 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01659 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01659 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01659 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P01659 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01659 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01659 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01659 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01659 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01659 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01659 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01659 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01659 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01659 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01659 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01659 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01659 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01659 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01659 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01659 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01659 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01659 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01659 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01659 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01659 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01659 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01659 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01659 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01659 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01659 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01659 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01659 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01659 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01659 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01659 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01659 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01659 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01659 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01659 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01659 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01659 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01659 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01659 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01659 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01659 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01659 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01659 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01659 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01659 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P01659 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01659 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01659 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01659 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01659 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01659 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P01659 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P01659 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01659 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01659 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01659 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01659 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01659 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01659 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01659 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01659 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01659 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01659 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01659 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01659 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01659 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01659 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01659 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01659 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01659 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01659 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01659 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01659 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01659 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms