Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lancl1O89112 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lancl1O89112 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lancl1O89112 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lancl1O89112 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lancl1O89112 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lancl1O89112 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lancl1O89112 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lancl1O89112 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lancl1O89112 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lancl1O89112 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lancl1O89112 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lancl1O89112 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lancl1O89112 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lancl1O89112 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lancl1O89112 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lancl1O89112 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms