Protein–RNA interactions for Protein: O55208

Figla, Factor in the germline alpha, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FiglaO55208 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FiglaO55208 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FiglaO55208 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FiglaO55208 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
FiglaO55208 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FiglaO55208 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FiglaO55208 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FiglaO55208 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FiglaO55208 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FiglaO55208 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FiglaO55208 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FiglaO55208 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FiglaO55208 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms