Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NlkO54949 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NlkO54949 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NlkO54949 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NlkO54949 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NlkO54949 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NlkO54949 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NlkO54949 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NlkO54949 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NlkO54949 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NlkO54949 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NlkO54949 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NlkO54949 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NlkO54949 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NlkO54949 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NlkO54949 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NlkO54949 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NlkO54949 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NlkO54949 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NlkO54949 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NlkO54949 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NlkO54949 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NlkO54949 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NlkO54949 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NlkO54949 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NlkO54949 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NlkO54949 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NlkO54949 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NlkO54949 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NlkO54949 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NlkO54949 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NlkO54949 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NlkO54949 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NlkO54949 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NlkO54949 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NlkO54949 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NlkO54949 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NlkO54949 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NlkO54949 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NlkO54949 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NlkO54949 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NlkO54949 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NlkO54949 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NlkO54949 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NlkO54949 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NlkO54949 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NlkO54949 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NlkO54949 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NlkO54949 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NlkO54949 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NlkO54949 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NlkO54949 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NlkO54949 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NlkO54949 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NlkO54949 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NlkO54949 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NlkO54949 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NlkO54949 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NlkO54949 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NlkO54949 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NlkO54949 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NlkO54949 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NlkO54949 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NlkO54949 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NlkO54949 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NlkO54949 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NlkO54949 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NlkO54949 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NlkO54949 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NlkO54949 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NlkO54949 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NlkO54949 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NlkO54949 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NlkO54949 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NlkO54949 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NlkO54949 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NlkO54949 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NlkO54949 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NlkO54949 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NlkO54949 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NlkO54949 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NlkO54949 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NlkO54949 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NlkO54949 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NlkO54949 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NlkO54949 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NlkO54949 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NlkO54949 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NlkO54949 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NlkO54949 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NlkO54949 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NlkO54949 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NlkO54949 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NlkO54949 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NlkO54949 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NlkO54949 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NlkO54949 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NlkO54949 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NlkO54949 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NlkO54949 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms