Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Edil3O35474 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Edil3O35474 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Edil3O35474 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Edil3O35474 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Edil3O35474 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Edil3O35474 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Edil3O35474 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Edil3O35474 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Edil3O35474 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Edil3O35474 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Edil3O35474 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Edil3O35474 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Edil3O35474 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Edil3O35474 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Edil3O35474 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Edil3O35474 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Edil3O35474 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Edil3O35474 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Edil3O35474 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Edil3O35474 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Edil3O35474 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Edil3O35474 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Edil3O35474 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Edil3O35474 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Edil3O35474 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms