Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Polr1aO35134 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Polr1aO35134 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Polr1aO35134 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms