Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarb2O35114 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms