Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms