Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp2O08574 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp2O08574 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms