Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6871L7N248 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm6871L7N248 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6871L7N248 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6871L7N248 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6871L7N248 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6871L7N248 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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