Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms