Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Gm20918J3QN17 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm20918J3QN17 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gm20918J3QN17 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gm20918J3QN17 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Gm20918J3QN17 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Gm20918J3QN17 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Gm20918J3QN17 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Gm20918J3QN17 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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