Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zkscan2G3X952 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zkscan2G3X952 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zkscan2G3X952 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zkscan2G3X952 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zkscan2G3X952 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zkscan2G3X952 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Zkscan2G3X952 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zkscan2G3X952 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zkscan2G3X952 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zkscan2G3X952 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zkscan2G3X952 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zkscan2G3X952 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zkscan2G3X952 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zkscan2G3X952 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zkscan2G3X952 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zkscan2G3X952 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Zkscan2G3X952 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zkscan2G3X952 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zkscan2G3X952 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zkscan2G3X952 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zkscan2G3X952 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms