Protein–RNA interactions for Protein: F8VQK7

Gm16519, Predicted gene, 16519, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16519F8VQK7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm16519F8VQK7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm16519F8VQK7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms