Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NpcdF8VQB8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NpcdF8VQB8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms