Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP0

Zfp708, Zinc finger protein 708, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp708F8VPP0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms