Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
D430041D05RikF6ZGR6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
D430041D05RikF6ZGR6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms