Protein–RNA interactions for Protein: F6VWU8

Zfp946, Zinc finger protein 946, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp946F6VWU8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp946F6VWU8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp946F6VWU8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp946F6VWU8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp946F6VWU8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp946F6VWU8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp946F6VWU8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp946F6VWU8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp946F6VWU8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms