Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms