Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P5

Gm3127, Predicted gene 3127, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3127E9Q9P5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3127E9Q9P5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3127E9Q9P5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3127E9Q9P5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3127E9Q9P5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3127E9Q9P5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3127E9Q9P5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3127E9Q9P5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3127E9Q9P5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3127E9Q9P5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3127E9Q9P5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3127E9Q9P5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3127E9Q9P5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3127E9Q9P5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3127E9Q9P5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3127E9Q9P5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3127E9Q9P5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3127E9Q9P5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3127E9Q9P5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3127E9Q9P5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3127E9Q9P5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3127E9Q9P5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3127E9Q9P5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3127E9Q9P5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3127E9Q9P5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3127E9Q9P5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms