Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms