Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms