Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Lrp3E9Q1T6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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