Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim5E9PV98 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms