Protein–RNA interactions for Protein: E9PUQ3

AU019823, Expressed sequence AU019823, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU019823E9PUQ3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AU019823E9PUQ3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AU019823E9PUQ3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AU019823E9PUQ3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AU019823E9PUQ3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AU019823E9PUQ3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AU019823E9PUQ3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms