Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms