Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17333C6EQI3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17333C6EQI3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17333C6EQI3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17333C6EQI3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17333C6EQI3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm17333C6EQI3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17333C6EQI3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17333C6EQI3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17333C6EQI3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm17333C6EQI3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17333C6EQI3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17333C6EQI3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17333C6EQI3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17333C6EQI3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17333C6EQI3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17333C6EQI3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm17333C6EQI3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm17333C6EQI3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm17333C6EQI3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm17333C6EQI3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm17333C6EQI3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gm17333C6EQI3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gm17333C6EQI3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gm17333C6EQI3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gm17333C6EQI3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gm17333C6EQI3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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