Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apol6B7ZC55 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apol6B7ZC55 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 419.6 ms