Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms