Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms