Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cavin4A2AMM0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cavin4A2AMM0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cavin4A2AMM0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cavin4A2AMM0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cavin4A2AMM0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cavin4A2AMM0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cavin4A2AMM0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cavin4A2AMM0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cavin4A2AMM0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cavin4A2AMM0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cavin4A2AMM0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cavin4A2AMM0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cavin4A2AMM0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cavin4A2AMM0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cavin4A2AMM0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms