Protein–RNA interactions for Protein: A2AGX3

Prdm11, PR domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm11A2AGX3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm11A2AGX3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms