Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Y3

Ighv1-80, Immunoglobulin heavy variable 1-80 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-80A0A075B5Y3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms