Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Upk1bQ9Z2C6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk1bQ9Z2C6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms