Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L1

S1pr4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1pr4Q9Z0L1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
S1pr4Q9Z0L1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
S1pr4Q9Z0L1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
S1pr4Q9Z0L1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
S1pr4Q9Z0L1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
S1pr4Q9Z0L1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
S1pr4Q9Z0L1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
S1pr4Q9Z0L1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
S1pr4Q9Z0L1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
S1pr4Q9Z0L1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
S1pr4Q9Z0L1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
S1pr4Q9Z0L1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms