Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stxbp4Q9WV89 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms