Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA3Q9UL41 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms