Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms