Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Slit2Q9R1B9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Slit2Q9R1B9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slit2Q9R1B9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slit2Q9R1B9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slit2Q9R1B9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slit2Q9R1B9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slit2Q9R1B9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slit2Q9R1B9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slit2Q9R1B9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slit2Q9R1B9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slit2Q9R1B9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Slit2Q9R1B9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Slit2Q9R1B9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slit2Q9R1B9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slit2Q9R1B9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slit2Q9R1B9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slit2Q9R1B9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slit2Q9R1B9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slit2Q9R1B9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Slit2Q9R1B9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slit2Q9R1B9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slit2Q9R1B9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slit2Q9R1B9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms